液體培養基：用各種營養成分加水配成，或用天然物質的浸汁(麥芽汁、豆芽汁等)制成。組分均一，適宜各類微生物的營養生長。廣泛應用于實驗研究及大規模工業生產中，有利于廣泛獲得大量菌體或代謝產物。

固體培養基：在液體培養基中加入凝固劑，或用麩皮等固體原料配制。常用的凝固劑是瓊脂(又稱瓊膠、洋菜)，由石花菜等海藻中提取加工制成。市售瓊脂為條狀、片狀或粉末狀，主要成分為多聚半乳糖的硫酸酯，絕大多數微生物不能將其分解，在培養基中僅起支撐作用。其熔點約98℃，凝固點42℃，1.5～2％的水溶液在一般培養溫度下呈凝膠狀態。瓊脂固體培養基廣泛應用于微生物的分離培養、菌種鑒定和保藏。

半固體培養基：液體培養基中加入0.2～0.5％瓊脂制成。用于觀察細菌的運動、菌種鑒定及測定噬菌體的效價等。

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